Materiale

Descrizione

Algoritmo in linguaggio R per l'analisi statistica di dati derivanti da esperimenti di PCR real-time per la quantificazione assoluta di acidi nucleici.

Referenza

Verderio P et al. BMC Bionformatics, 2008; 9:13 (PDF)

Materiali scaricabili

FCI.zip

La cartella compressa FCI.zip contiene i seguenti file:

1. Guida all'utilizzo di FCI (Guida_utilizzo_FCI.pdf)
2. Dataset di esempio (example_data.csv)
3. Algoritmo FCI in linguaggio R (FCI_1_3.txt)
4. Codice con i comandi per importare i dati, implementare l'algoritmo FCI e visualizzare i risultati (FCI_run.txt)
5. Guida all'interpretazione dei risultati (Guida_interpretazione_risultati.pdf)
6. Output prodotto dall'algoritmo FCI (FCI_output.pdf)
7. Figura prodotta dall'algoritmo FCI (FCI_figura.pdf)
8. Versioni precedenti dell'algoritmo (FCI_1_2.txt, FCI_1_1.txt)

Descrizione

Algoritmo in linguaggio R utile per l'identificazione di un ridotto numero di microRNA da utilizzare per la normalizzazione di dati derivanti da esperimenti di qPCR ad alta dimensionalità (high-throughput qPCR) in vista di futuri studi di validazione.

Referenza

Verderio P et al. Analytical Biochemistry, 2014

Materiali scaricabili

NqA.zip

La cartella compressa NqA.zip contiene i seguenti file:

1. Guida all'utilizzo di NqA e all'interpretazione dei risultati (userguide_NqA.pdf)
2. Dataset di esempio (1.1Inputfile.dat, 1.2Inputfile.dat)
3. Algoritmo NqA in linguaggio R (NqA_code.R)
4. Codice con i comandi per importare i dati, implementare l'algoritmo NqA e visualizzare i risultati (NqA_output.pdf)
5. Output prodotto dall'algoritmo NqA (NqA_output.pdf)
6. Figura prodotta dall'algoritmo NqA (NqA_figura.pdf)